Ιδρύθηκε το 2000 με Χορηγό το Ίδρυμα Σταύρος Σ. Νιάρχος και την αμέριστη συμπαράσταση του Δημάρχου κ. Κώστα Αδαμίδη και του Δημοτικού Συμβουλίου Μούδρου.
Φιλοξενείται στα Ολοήμερα Δημοτικά Σχολεία Μούδρου και η λειτουργία του χρηματοδοτείται από το Δήμο Μούδρου. Μαθητές του Μουσικού Εργαστηρίου επισκέφθηκαν τη Σαντορίνη το καλοκαίρι του 2004, συμμετείχαν στη συναυλία του Μουσικού Εργαστηρίου Σαντορίνης και πήραν μέρας σε διεθνές σεμινάριο κιθάρας με το Βαγγέλη Μπουντούνη. Επίσης τα παιδιά του Μουσικού Εργαστηρίου έδωσαν συναυλία στο χωριό Κοντιά της Λήμνου.
40 μαθητές διδάσκονται προπαιδεία, πιάνο και χορωδία από τη Νίκη Μπουζιωτοπούλου, κλασική κιθάρα από τον Κώστα Κωνσταντόπουλο και πιάνο από το Μάκη Kαλλιάνη.